3月16日,河南農(nóng)業(yè)大學(xué)康相濤教授團(tuán)隊(duì)基于前期雞泛基因組研究成果與公共數(shù)據(jù),開發(fā)了適用于我國地方雞基因組系列液相芯片——“神農(nóng)1號”。該系列芯片的成功研發(fā),搭建了用于地方雞種質(zhì)資源鑒定、精準(zhǔn)評價、保護(hù)與開發(fā)利用的高效技術(shù)平臺,對我國家禽種業(yè)振興與可持續(xù)發(fā)展具有重要的意義。

58個地方雞品種地理分布
該系列芯片采用模塊組合的設(shè)計(jì)思路:模塊I是利用66.5M泛基因組序列,設(shè)計(jì)5K標(biāo)記;模塊II是整合生長、繁殖、屠體等性狀GWAS的功能位點(diǎn),設(shè)計(jì)5K標(biāo)記;模塊III是整合我國58個地方雞種中高頻SNP位點(diǎn),設(shè)計(jì)30K標(biāo)記;模塊IV是整合生長、羽色等性狀的原因InDel、SV、PAV突變位點(diǎn)。集成上述模塊,創(chuàng)制了40K、5K地方雞基因組系列芯片——“神農(nóng)1號”。

“神農(nóng)1號”40K地方雞基因組芯片位點(diǎn)分布

“神農(nóng)1號”地方雞基因組液相芯片試劑盒
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽團(tuán)隊(duì)是教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)?,F(xiàn)有16名骨干成員,其中教授9人、副教授3人。團(tuán)隊(duì)帶頭人康相濤教授先后榮獲全國先進(jìn)工作者、中華農(nóng)業(yè)英才獎和首屆國際種業(yè)科學(xué)家獎等。團(tuán)隊(duì)長期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護(hù)和利用開展研究,先后主持承擔(dān)國家“863”計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金、神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室“一流課題”項(xiàng)目等國家和省部級科研項(xiàng)目;主持培育國審新品種2個,完成的《中國地方雞種質(zhì)資源優(yōu)異性狀發(fā)掘創(chuàng)新與應(yīng)用》獲國家技術(shù)發(fā)明獎二等獎、《地方雞保護(hù)利用技術(shù)體系創(chuàng)建與應(yīng)用》獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎二等獎,授權(quán)國家發(fā)明專利46項(xiàng),制定國家和地方標(biāo)準(zhǔn)10項(xiàng),發(fā)表中英文論文500余篇。
上述研究成果的取得主要依托于神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部畜禽資源(家禽)評價利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省家禽育種國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等省部級研究平臺,以及保存了29個特色資源、設(shè)施設(shè)備一流的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場。
參考文獻(xiàn)
1.Wang K, Hu H, Tian Y, Li J, Scheben A, Zhang C, Li Y, Wu J, Yang L, Fan X, Sun G, Li D, Zhang Y, Han R, Jiang R, Huang H, Yan F, Wang Y, Li Z, Li G, Liu X, Li W, Edwards D, Kang X. The Chicken Pan-Genome Reveals Gene Content Variation and a Promoter Region Deletion in IGF2BP1 Affecting Body Size. Mol Biol Evol. 2021, 38(11):5066-5081.
2.https://omia.org/home/
3.Wang M, Thakur Mukesh, Peng M et al, 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Research, 2020, 30:693–701.
4.https://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/GG/index.
免責(zé)聲明:
- 1、河南畜牧獸醫(yī)信息網(wǎng)刊登的文章僅代表作者個人觀點(diǎn),文章內(nèi)容僅供參考,并不構(gòu)成投資建議,據(jù)此操作,風(fēng)險自擔(dān)。
- 2、河南畜牧獸醫(yī)信息網(wǎng)轉(zhuǎn)載的文章均已注明來源,版權(quán)歸原作者所有,內(nèi)容僅供讀者參考,如有侵犯原作者權(quán)益,請及時聯(lián)系我們刪除?。娫挘?371-65778965 )
- 3、河南畜牧獸醫(yī)信息網(wǎng)原創(chuàng)文章,轉(zhuǎn)載請注明出處及作者。感謝您的支持和理解!