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禽流感又發(fā)生變異:內(nèi)地首次從雞分離出H9N6病毒

放大字體  縮小字體🕓2017-11-20  💛2500

活禽市場是人感染禽流感病毒的重要來源之一。近日,中國疾病預(yù)防控制中心病毒病所聯(lián)合江西省疾控中心在Arch Virol雜志上發(fā)表題為《Identification of a novelreassortant A (H9N6) virus in live poultry markets in Poyang Lake region, China》的論文,研究首次在江西省南昌市鄱陽湖區(qū)分離鑒定了一株新型重配H9N6流感病毒(JX-H9N6)。與以往報告的H9N6不同,JX-H9N6起源于2014年H9N2和H6N6兩種病毒的重組,雖然該H9N6病毒顯示為低致病性特征,但是其HA、PB1、PA、M和NS蛋白存在多個可增加哺乳動物的傳播力和毒力的突變。目前,H9N2和H6N6 禽流感 均廣泛分布在家禽中并有助于產(chǎn)生新的重組病毒并造成人類感染,本研究再次強調(diào)了加強禽類監(jiān)測對早期預(yù)測人類感染的重要性。
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研究背景

流感病毒屬于正黏病毒科流感病毒屬,為單負鏈分節(jié)段具有包膜結(jié)構(gòu)的RNA病毒。流感病毒具有廣泛的宿主范圍,可同時感染哺乳動物和鳥類等。根據(jù)其表面蛋白血凝素蛋白HA和神經(jīng)氨酸酶NA的抗原性差異,可分為至少18個H亞型(H1-H18)和11個N亞型(N1-N11)。到目前為止,除了H17N10和 H18N11病毒只在蝙蝠中檢測到外,所有其它HA和NA亞型均在禽類中有報道。流感病毒的分段RNA基因組與RDPR聚合特點使其非常容易通過突變或重組逃逸宿主免疫系統(tǒng)。
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禽類尤其是水禽,是禽流感病毒的天然宿主。禽流感病毒可以偶爾"跳躍",越過寄主屏障感染哺乳動物人類。人類通常沒有預(yù)先存在的免疫力禽流感。禽流感傳染給人一般導(dǎo)致溫和或無癥狀感染,只有少數(shù)亞型領(lǐng)先嚴(yán)重肺炎甚至死亡。在歷史上已知的可感染人類的禽流感病毒有H5N1, H5N6, H6N1, H7N2, H7N3, H7N7, H7N9, H9N2, H10N7和H10N8。

H9N2禽流感目前普遍存在家禽和野鳥中,該病毒于1966年首次報道,1994年在中國廣東省的一個養(yǎng)雞場中檢測到,此后,H9N2禽流感病毒偶爾通過物種屏障感染哺乳動物和人類。1999年,中國學(xué)者成功從有流感樣癥狀的患者中分離出一種 H9N2病毒,2003年,中國又報道了17例人感染H9N2禽流感病例,此外,研究顯示,2013年人感染的H7N9和H10N8中的六個內(nèi)部基因也源自H92禽流感,云南及廣東省的H5N6病毒的監(jiān)測也證明了其內(nèi)部基因病毒已逐漸被H9N2病毒內(nèi)部基因替換,從而促進了H9N2在家禽中的傳播。

自2009年以來,國家流感中心就在全國31個省市自治區(qū)的活家禽市場和野生鳥類棲息地進行了采集樣品和禽流感病毒監(jiān)測。位于中國省江西的鄱陽湖是亞洲的候鳥一個主要的聚集地,這一地區(qū)的居民鳥類和候鳥增加了禽流感病毒的傳播和重組。本研究則首次在鄱陽湖地區(qū)鑒定發(fā)現(xiàn)了一種新型重組H9N6流感病毒。
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Potential origin of the JX-H9N6 virus.

結(jié)果速覽

1、一種新型重配H9N6流感病毒的分離與鑒定
研究者從2014年3月-12月之間于鄱陽湖地區(qū)11個活禽市場中收集的683份樣本中分離得到429株病毒,包括159株H9N2,47株H5N6,33株H6N6,20株H7N9,4株H3N2,4株H5N8,3株H4N2,3株H4N6,2株H11N3,1株H7N2,1株H9N6以及90個混合感染樣本。

H9N6是從2014年4月22日江西省南昌市新建縣活禽市場的糞便樣本分離得到,病毒被命名為A/Environment/Jiangxi/24429/-2014(H9N6),以下簡稱 JXH9N6。JX-H9N6 全基因組序列已提交到GISAID數(shù)據(jù)庫,對應(yīng)的序列號為EPI861128至EPI861135。JX-H9N6在MDCK和A549細胞中的TCID50分別為10 5.75/mL和10 6.3/mL,EID50為10 10.5/mL。

2、新型重配H9N6流感病毒序列特點與系統(tǒng)進化分析

全基因組序列分析結(jié)果顯示(表 1),JX-H9N6的PB2、PA、HA和MP與2013–2014浙江省H9N2分離株相似度高達99%,NS與A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9),PB1與A/chicken/Jiangxi/13537/2014(H7N9)同源性最高,NA和NP與江西省 2014年分離的H10N6病毒株的同源性最高。
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與此相比,JX-H9N6與其他H9N6病毒的HA相似性僅有75.6–95.3%,NA的相似性僅有81.5–86.5%(表2)。

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對8個片段進行貝葉斯共進化分析結(jié)果表明,JX-H9N6病毒與早期報道的H9N6病毒不同,表明JX-H9N6最早來自A/chicken/Jiangxi/-19426/2014-like H9N2和H6N6流感病毒的重配,重配時間發(fā)生與2014年的1月和3月。
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3、宿主特異性的特征標(biāo)記、受體結(jié)合特點與致病性分析

表3綜述了JX-H9N6病毒的宿主特異性、受體結(jié)合特點與致病性特點。
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JX-H9N6的HA裂解部位僅包含一個單一的堿性(PSRSSR↓GLF),表明該病毒是一個低致病性禽流感。JX-H9N6的HA中Q226L替換表明病毒的增加α2,6 與唾液酸受體的結(jié)合與促進哺乳動物之間的傳輸能力。

JX-H9N6的HA蛋白含有七個N-糖基化位點:分別位于21, 73, 128,289、296、304和483。但是JX-H9N6卻缺乏所有6株早期報告的H9N6共有的210位可能的糖基化位點,與2012年以來從鳥類和人中分離出來的H9N2最相似(補充圖2),210位置的N-糖基化部位的損失的功能需要進一步研究。

此外,JX-H9N6在NA蛋白質(zhì)莖部位置(59–69)含有11個氨基酸刪除,表明病毒已成為很好地適應(yīng)陸禽。然而,PB2蛋白627和701分別保持E和D。PB1蛋白的L13P和L473V替代以及PA蛋白的K356R置換均有可能增加病毒的聚合酶活性、復(fù)制效率和在哺乳動物中的毒力。M1蛋白N30D和T215A替換以及NS1蛋白A/P42S和T/D/V/R/A127N的替代有可能會增加其在哺乳動物中毒力,此外,M2蛋白中還存在金剛烷胺的抗性替代S31N。

4、靜脈致死性指數(shù)試驗
接受靜脈注射JX-H9N6病毒或?qū)φ詹《咀⑸涞碾u在在10天觀察期間均為顯示流感感染的癥狀,表明JX-H9N6 病毒是低致病性禽流感。
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小 結(jié)

1、關(guān)于H9N6禽流感的報道很少,首個H9N6病毒于1977年在中國香港特別行政區(qū)被發(fā)現(xiàn)。此后分別于1988年在美國、2006年在越南、2010年、2013和2014在斯洛伐克的禽流感監(jiān)測中有報道。目前,這是首次中國大陸發(fā)現(xiàn)H9N6病毒的報道,也是首次將從雞分中分離出來H9N6的報道。

2、系統(tǒng)進化分析表明,JX-H9N6和以前報道的H9N6病毒沒有密切聯(lián)系,是一種H9N2和H6N6重組病毒株。分子年代分析表明,JX-H9N6起源于H9N2和H6N6病毒的重組,可能發(fā)生2014年1月-3月之間。如其他研究報告所述,同期H6N6也提供其N6基因給其他流感病毒亞型,導(dǎo)致H3N6、H5N6和H10N6病毒的出現(xiàn)。

3、H9N2在世界范圍內(nèi)的家禽和野禽中廣泛分布,該病毒被認為是最有可能在人類中引發(fā)下一次流感大流行的候選者,主要原因:一方面由于其在1998年以來引起了人類的感染并從2013年以來在禽類中的不斷增加,另一方面,H9N2病毒內(nèi)部基因在各種禽流感病毒具有貢獻,包括中國自2013年發(fā)現(xiàn)的人感染H7N9、H10N8、H5N6等,而H9N2和H6N6病毒在中國家禽中又廣泛存在。為此,本研究強調(diào)了H9N2和H6N6可能會成為新型重配病毒庫。

4、雖然JX-H9N6 為低致病性禽流感,但是一些突變位點的存在,包括HA蛋白的Q226L以及其它內(nèi)部基因的突變,都提示病毒獲得了在哺乳動物細胞中的復(fù)制能力。此外,NA莖部區(qū)域11個氨基酸的刪除可能有助于幫助這些H9N6病毒適應(yīng)陸禽。

中國活禽市場缺乏生物安全措施導(dǎo)致了活禽市場各種禽流感病毒傳播和累計,根據(jù)“基因調(diào)頻”理論,家禽種類混合的養(yǎng)殖會促進流感病毒的種間傳播和重組。近年來,中國報告幾種新型重組病毒引起的人類感染如H5N6、H7N9和H10N8病毒。因此,持續(xù)監(jiān)視、嚴(yán)格的動物檢疫和先進的生物安全措施,包括隔離期間家禽養(yǎng)殖和銷售在中國是至關(guān)重要的。

編輯:姚紅

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